中國科學(xué)院海洋研究所科研團(tuán)隊(duì)歷時(shí)10年成功破譯凡納濱對蝦（又稱“南美白對蝦”）基因組，并獲得高質(zhì)量的對蝦基因組參考圖譜，研究成果在《自然》雜志子刊《自然通訊》在線發(fā)表。
中國科學(xué)院海洋研究所研究員相建海介紹，對蝦基因組是世界上公認(rèn)的高復(fù)雜基因組，中國科學(xué)院海洋研究所科研團(tuán)隊(duì)嘗試了從一代到三代的各種基因組測序平臺及各種組裝軟件，最終完成了凡納濱對蝦的全基因組測序和組裝，并獲得了高質(zhì)量的對蝦基因組參考圖譜。
通過分析發(fā)現(xiàn)，凡納濱對蝦共有約24億個(gè)堿基對。以1-6堿基為單位多次重復(fù)的簡單串聯(lián)序列（SSR）占對蝦基因組的23.93%以上，是目前已測基因組物種中含量最高的，這也是對蝦基因組高復(fù)雜性的根本原因。
此外，科研人員在對蝦基因組上發(fā)現(xiàn)了兩大結(jié)構(gòu)特征：大量的物種特異性基因和大量的串聯(lián)重復(fù)基因，這可能與對蝦科的特異性進(jìn)化有密切聯(lián)系。
中國科學(xué)院海洋研究所研究員李富花表示，對蝦基因組的破譯，為甲殼動物底棲適應(yīng)和蛻皮等研究提供了重要理論基礎(chǔ)和數(shù)據(jù)支撐，同時(shí)也為對蝦基因組育種和分子改良工作提供了重要基礎(chǔ)平臺。
據(jù)了解，凡納濱對蝦作為四大養(yǎng)殖蝦類之首，其全球年產(chǎn)量達(dá)416萬噸，具有非常重要的經(jīng)濟(jì)價(jià)值。我國的凡納濱對蝦產(chǎn)量占全球的四分之一以上。由于種質(zhì)資源匱乏，我國每年需從國外引進(jìn)大量凡納濱對蝦苗種。
“凡納濱對蝦基因組的破譯，將有力促進(jìn)我國對蝦分子育種和全基因組育種的發(fā)展，產(chǎn)生我國自主培育的凡納濱對蝦品種，推動我國種業(yè)發(fā)展。”李富花說。