日前,中科院海洋所研究員楊紅生課題組和相建海、李富花研究員課題組,與天津生物芯片技術(shù)公司、加拿大紐芬蘭紀念大學(xué)等單位合作,首次完成了仿刺參(俗稱海參)的全基因組精細參考圖譜的繪制,揭示了海參的特殊形態(tài)進化與強大再生潛能的分子基礎(chǔ)。相關(guān)研究在《科學(xué)公共圖書館—生物學(xué)》在線刊發(fā)。
海參處于從無脊椎向脊椎動物分化的獨特進化地位,也是國內(nèi)外重要的海產(chǎn)經(jīng)濟物種,具有極高的營養(yǎng)與醫(yī)用價值。研究人員構(gòu)建了海參全基因組的精細圖譜,分析發(fā)現(xiàn)了調(diào)控動物關(guān)鍵進化過程中脊索形成的關(guān)鍵轉(zhuǎn)錄因子在棘皮動物中顯著收縮,提示了棘皮動物在長期的進化過程中脊索、咽鰓裂消失的潛在原因。海參的近親海膽具有顯著、發(fā)達的外骨骼,而海參外觀柔軟,骨骼退化為細小的桌形體,基因組解析發(fā)現(xiàn)它們都具有相對完整的骨骼發(fā)育通路,不同之處在于海膽的礦化基因為31個,海參縮減為7個,而且海參礦化基因在發(fā)育過程中低表達,是其骨骼顯著退化的根本原因。
該研究利用多組學(xué)方法揭示了海參超強再生能力的分子機制,為組織器官再生機制與再生醫(yī)學(xué)應(yīng)用、棘皮動物進化等研究提供了范式,也為海參遺傳選育提供了完整、重要的理論基礎(chǔ)。